মোঘলদের শাসনামল ১৫৭৬-১৭০৭ খ্রি.। তারা শাসন করতেন কুচবিহার থেকে আসাম পর্যন্ত। এর মধ্যে ছিল উড়িষ্যা ও বাংলার সীমান্ত পর্যন্ত। এর মধ্যে উল্লেখযোগ্য স্থান পাণ্ডুয়া ও মুশির্দাবাদ। মোঘল সাম্রাজের অবসান হয় সপ্তদশ শতাব্দীর প্রথামার্ধে। পলাশির প্রান্তরের নবাব সিরাজউদ্দৌলার পতনের পর ইস্ট ইন্ডিয়া কোম্পানি বাণিজ্যের উদ্দেশ্য ১৭৭৫ সালে এদেশে আসে। দেওয়ানি ক্ষমতা প্রাপ্ত হয়ে তারা রাজস্ব আদায় ও বিচার কার্য্য পরিচলনা করতেন। এত বড় সাম্রাজ্য শাসন করা সম্ভব হত না। বাংলা সীমান্তের একাংশ নিয়ে যশোর জেলার আত্মপ্রকাশ।

১৭৫১ সালের কথা, ঝিনাইদহ, মাগুরা, সাতক্ষীরা, খুলনা, নড়াইল এবং পশ্চিমবঙ্গ এর পরিধি। মুড়ুলি ছিল থানা। সুন্দরবন পর্যন্ত শাসন করা সম্ভব হত না। খাজনা বকেয়া পড়ত। সুন্দরবন এলাকায় ডাকাতি বেড়ে যায়। নতুন জেলার প্রয়োজন হয়ে পড়ে। ১৮৪২ সালে খুলনা মহাকুমার যাত্রা শুরু হয়। এটি দেশের প্রথম মহাকুমা। নয়াবাদের সন্নিকটেই এ মহাকুমার অফিস স্থাপিত হয়। এখানে মহাকুমার ম্যাজিস্ট্রেটের অফিস হওয়ায় নীলকর উইলিয়াম রেনী অস্বস্তিবোধ করেন। তার পরামর্শে রূপসা ও ভৈরব নদের মিলনস্থলের পাশে মির্জাপুর মাঠের উত্তরে উচু স্থানে মহাকুমা সদর দপ্তর স্থাপন করা হয়। স্থানটি আজকের জেলা প্রশাসকের বাসভবন। এই স্থানটি এক সময় মির্জাপুরের মাঠ বলে পরিচিত ছিল।

১৮৮২ সালে খুলনা জেলা হিসেবে স্বীকৃতি পায়। ১৮৮২ সালের ২৫ এপ্রিল খুলনা জেলার গেজেট নেটিফিকেশন হয়। ১ জুন থেকে জেলার কার্যক্রম শুরু হয়। সাতক্ষীরা, নড়াইল, খুলনা ও বশিরহাট মহাকুমার অংশ নিয়ে খুলনা জেলার যাত্রা। তখনকার দিনে ইন্টারনেট সুবিধা ছিল না। দৈনিক কোন পত্রিকা প্রকাশিত হত না। কলকাতার পত্রিকার ওপর নির্ভরশীল হতে হত। পত্রিকা আসত তিন দিন পর। তাও ডাক যোগে। দৈনন্দিন খবরাখবর জানার সুযোগ ছিল না। এ সুখবরটি প্রকাশিত হয় একটি ইংরেজি দৈনিকের পাতায়। নাম দি স্টেটসম্যান।

১৮৮১ সালের ২ মে কলকাতা থেকে প্রকাশিত দি স্টেটসম্যান নামক পত্রিকার এক খবরে বলা হয় “New District: From the Isntant the much Talked New District formed of the Sub-division of Satkhira, Norail, Khulna and part of the Bashirhat has been Organised at Head quarters of the Sub- division bearing the name of the disrtict. The district is a third class having one. a district Magistrate and Collector at its head of affairs. The Chief civil authority for the time Bing is a Subbordinate. The civil and Sessions judge of Jessore. It has been arrnged will hold Sessions form time the Head quarters”.